Eindringlinge

Selina wird schwer verletzt in Begleitung von Bruce ins Krankenhaus gebracht. Derweil hält die Polizei Jeremiah gefangen, der ein Gespräch mit Bruce fordert. Anderenfalls droht er mit weiteren Bombenexplosionen in der ganzen Stadt. Indes unterstützen Tabitha und Oswald Butch dabei, sich wieder in einen Menschen zu verwandeln. Ed ist dagegen eifersüchtig auf Gordon und entführt ihn, um ihn als vermeintlichen Konkurrenten um Lees Herz loszuwerden.

Jeremiah übernimmt Jeromes Armee und plant, eine neue Stadt zu errichten. Dazu will er alle Gebäude Gothams mithilfe von Bomben zerstören. Er gibt Bullock sechs Stunden Zeit, die Bewohner der Stadt zu evakuieren. Um auch Bruce zu manipulieren, bringt Jeremiah Alfred als Lockvogel in seine Gewalt und schießt auf Selina. Während Gordon der Explosion im Bunker entkommt, überzeugt Lee Nygma, ihn bei der Entschärfung der Bomben zu unterstützen.

Jeromes Anhänger graben die Leiche ihres Anführers auf dem Friedhof aus, nachdem eine mysteriöse Unbekannte ihnen diesen Auftrag in Jeromes Namen erteilt hat. Bullock will derweil Gordon überreden, Thompkins freizulassen - dieser ist jedoch angesichts der von ihr verübten Banküberfälle anderer Meinung. Also beschließt der Riddler, Thomkins zu retten. Gordon erhält eine Videokassette mit Jeromes letztem Willen, der absolutes Chaos auslöst.

Tabitha lockt Selina und Bruce zu Ra's al Ghuls Grab. Dort zwingt sie Bruce, mithilfe seines Bluts den Gründer der Liga der Schatten wiederzubeleben. Als sich Barbara daraufhin weigert, Ra's den Dämonenkopf zurückzugeben, greift er sie an. Indes kümmern sich Gordon und Bullock um eine Serie von Banküberfällen, die der Riddler gemeinsam mit Lee begangen hat. Als diese die Beute in den Narrows verschenken, fordern auch Pinguin und Grundy ihren Anteil.

Die ausgebrochenen Insassen aus Arkham nehmen den Bürgermeister und weitere einflussreiche Einwohner Gothams gefangen. Jerome tötet eine Geisel nach der anderen, während er darauf wartet, dass Gordon ihm seinen Zwillingsbruder Jeremiah und Bruce ausliefert. Jeromes Gefolgschaft besorgt indes mehr Halluzinationen hervorrufendes Lachgas, um die Stadt in ein Irrenhaus zu verwandeln. Barbara findet sich derweil immer besser in ihre Funktion als Führerin der Liga der Schatten ein.

Jerome versammelt die Bösewichte der "Legion der Schrecklichen" und schießt auf der Suche nach Xander Wilde wahllos in der Firma Wayne Enterprises um sich. Bruce folgt seiner Spur und gerät in Gefahr. Er hilft Bullock und Gordon, den mysteriösen Wilde zu finden und sein Geheimnis aufzudecken. In den Narrows eröffnet Nygma eine Bar und veranstaltet ein Rätselspiel. Thompkins fordert ihn heraus und gewinnt mit einer List.

Tetch hat einen diabolischen Plan: Er will Gothams Einwohner per Radio hypnotisieren, um sie alle in den Suizid zu treiben. Gordon muss schnell handeln, um dieses schreckliche Verbrechen zu vereiteln. Bruce versucht derweil, Jerome aufzuspüren, der aus Arkham geflohen ist. Obwohl Bruce die Möglichkeit hatte, ihn auszuschalten, hat er diese nicht genutzt. Daraufhin fühlt er sich zwar an Jeromes Verbrechen mitschuldig, aber er rettet ihm dennoch erneut das Leben.

Pinguin macht gemeinsame Sache mit dem Riddler, um Sofia zu schnappen. Thompkins soll sie dabei unterstützen. Sofia hetzt derweil Pinguin ihre Anhänger auf den Hals. Bullock und Gordon wollen ihrerseits Sofia das Handwerk legen und stellen sie in einem Spa. Die Situation gerät jedoch außer Kontrolle, und Sofia ist kurz davor, Gordon umzubringen. Aber Hilfe naht von unerwarteter Seite.

Sofia schlägt Thompkins ein schier unerfüllbares Ultimatum vor, um ihren eigentlichen Plan zu verfolgen und die Narrows Sampson zu überlassen. Indes verliert Ed den Kampf mit dem Riddler - mit der Konsequenz, dass sein Wille nun von diesem gesteuert wird. Mithilfe des Lazarus-Wassers hat Ivy eine lebensbedrohliche Giftpflanze kreiert und will alle Bewohner von Gotham infizieren. Dabei hat sie es besonders auf Harvey abgesehen, weil der ihren Vater getötet hat.

Ivy will wissen, was hinter dem sogenannten Projekt M. steckt und bedient sich dafür ihrer Fähigkeit zur Hypnose: Unter diesem Einfluss stehend, erzählt ihr Bruce alles Wesentliche darüber. Anschließend versetzt sie ihn mithilfe eines Gifts in einen Rausch - mit schwerwiegenden Folgen. Unterdessen wächst Jeromes Armee in Arkham. Pinguin hat allerdings wenig Interesse daran, zu Jeromes Anhängern zu zählen und freut sich daher über die Kontaktanfrage des Riddlers.

Gordon findet durch seine Nachforschungen heraus, dass Thomkins hinter dem Pseudonym "Doc" steckt. Sie will große Veränderungen für die Bewohner in den Narrows anstoßen und bringt sich dadurch selbst in Gefahr. Alfred macht derweil Bekanntschaft mit der netten Kellnerin Tiffany. Als diese jedoch von ihrem brutalen Freund umgebracht wird, fällt der Verdacht auf Alfred. Indes erwacht Ivy mit neuem Aussehen und noch mehr Kraft wieder zum Leben.